OBSERVATOIRE DES PATIENTS TRAUMATISÉS SÉVÈREStraumabase.eu
TRAUMABASE · GOLDEN BASE

Introduction à la Golden Base

Le registre, les sources de données et leur harmonisation.

La Traumabase est un registre français dédié aux patients traumatisés sévères. Elle rassemble les données des centres participants pour soutenir la recherche et mieux comprendre leur prise en charge.

La Golden Base est le jeu de données harmonisé issu des sources MediaXtend, CleanWeb V1 et CleanWeb V2. Cette documentation décrit les données et les règles nécessaires à leur interprétation.

01

Sources de données

La Traumabase est constituée de trois bases successives. Au fil du temps, des variables ont été ajoutées ou supprimées, certains formats et définitions ont changé, et les liens entre les données se sont structurés.

2012–2017

MediaXtend

9 882 patients

Base définitivement clôturée01
2017–2021

CleanWeb V1

18 145 patients

Base définitivement clôturée02
2021–aujourd’hui

CleanWeb V2

37 700 patients

Collecte en cours03

65 727 patients au total dans les trois sources, au .

Différences entre les sources

Un pipeline aligne et traite les données des trois sources pour construire la Golden Base. Certaines définitions ont évolué au cours du temps ; il faut en tenir compte lors de l’analyse.

Quelques exemples de différences entre les sources :

Exemple : définition du choc hémorragique
CHOC_HEMORRAG_V1≥ 4 unités de CGR
CHOC_HEMORRAG_V2≥ 1 unité de CGR

Au cours des six premières heures

Les deux variables sont conservées pour rendre explicite cette évolution de la définition.

Exemple : dates et délais
MediaXtendDates et délais saisis manuellement
CleanWeb V1 · V2Dates et heures saisies → délais calculés

Ces modalités de recueil sont à prendre en compte dans l’évaluation de la qualité des dates et des délais.

02

Construction de la Golden Base

La construction suit trois phases : réunir les sources, appliquer les règles cliniques, puis calculer les variables qui nécessitent des données déjà traitées.

Des sources à la Golden Base
Règles de traitementLes règles sont définies par les cliniciens du Groupe Traumabase, qui connaissent les données de chaque source et les spécificités de chaque variable.
  1. Trois sourcesMediaXtend
    CleanWeb V1
    CleanWeb V2
  2. Phase 1PrétraitementAlignement des colonnes et réunion des sources
  3. Base bruteUne structure commune
  4. Phase 2TraitementNormalisation des valeurs et application des règles métier et cliniques
  5. Phase 3Post-traitementConstruction des variables qui nécessitent les données traitées : TRISS, probabilité de décès…
  6. Golden BaseDonnées harmonisées
Suivi des transformationsLes indicateurs suivent l’évolution des valeurs et des distributions de chaque variable à chaque règle appliquée. Ils servent à valider la pertinence et la bonne application des règles.

Équipe et remerciements

Ce travail de préparation, de traitement et de documentation des données a été réalisé par l’équipe ci-dessous. Nous remercions l’ensemble de ses membres pour leurs contributions.

Groupe Traumabase

  • Dr. Anatole Harrois
  • Dr. Arthur James
  • Dr. Tobias Gauss

INRIA

  • Julie Josse
  • Dhia Merzougui

Capgemini Invent

  • Sofiane Medjkoune
  • Virginie Lam
  • Marie-Flore Huret
  • Adnene Khalbous

URC Lariboisière

  • Eric Vicaut
  • Béatrice HORCHOLLE